整個整體純水系統中從產水模塊、儲水模塊、分配模塊、管道純化和監控設備、到最后的終端純化模塊的選配，涉及到對實驗應用的了解、實驗室管理的思考、系統投入成本的控制、運行維護的要求、安裝操作和工程實施等多方面因素，用戶往往在牽涉大量精力后，效果卻并不很好。

　　為了減少上述不利因素的影響，應選用可萃性低、內壁光滑的管道并盡可能減少接頭及管件的凹凸不平。當然也要根據純水水質的級別進行選材，并注意材料的價格等，要統籌兼顧。根據材質的不同，高純水配管主要可分為有機系配管和不銹鋼配管兩大類。 有機系配管的品種常見的包括聚氯乙烯(PVC)，聚丙烯(PP)，丙烯腈-丁乙烯-苯乙烯(ABS)，聚偏二氟乙烯(PVDF)等4種。 有機配管材質對高純水水質的影響，目前尚無完整的比較資料及可靠的測試數據報道。各國有各自的選用習慣。 例如，美國多采用PVC管，英國多采用ABS管，而歐洲一些國家則常用PP管。PVDF管大多用于水質要求特別高的純水精處理系統。

　　純水輸送和分配管道系統是整個純水系統的重要組成部分，該系統將中央純水站制出的高質量純水以盡量小的水質降幅輸送給每一個使用地點。但由于水的純度很高，極易受到污染，而用水點較分散又無規律且變化幅度大等，給純水的盡可能的保質輸送帶來相當大的難度。目前配管設計中出現的兩大難題是：

　　(1)如何保持較高的管道設計流速，即在管道系統壓力損失允許的情況下管內流速盡量大，以防管內細菌繁殖和微粒沉積。

　　(2)如何防止純水管道系統內產生滯水、短路和逆向流動現象。

　　經過不斷地探索和實踐，現從設計角度提出幾種可供選擇的途徑：

　　①設計采用純水循環系統，并必須24h連續運行，以杜絕管內產生死水。

　　②為使運行中無論純水使用多少都能保證純水處于流動狀態，循環附加流量應為設計流量的50%～100%。

　　③應保證純水管道流速。純水循環干管最小流速宜大于1.5m/s，支管流速宜大于1.0m/s。

　　④對接使用點支管應盡量縮短，以減少死水管段。有文獻報道支管長度不宜超過30倍管徑長度。

　　⑤循環管道宜采用雙管布置方式，即有獨立的給水管和回水管的純水循環管道系統。